تهیه وتدوین برنامه جامع عملیاتی واحد
کشف به موقع همه گیری ها و برنامه ریزی جهت کنترل
پیگیری و نظارت بر انجام صحیح مراقبت بیماری ها
توزیع واکسن بین مراکز بهداشتی درمانی شهری و روستایی و خانه های بهداشت
نظارت بر اجرای برنامه ایمن سازی
انجام هماهنگی های درون بخشی و برون بخشی
جمع آوری آمار و ارسال به مرکز مدیریت بیماری ها
پایش و نظارت مستمر بر واحدهای محیطی و ارسال پسخوراند
اجرای طرحهای ارائه شده از سوی مرکز مدیریت بیماریها
تخمین و برآورد تجهیزات و داروهای لازم
برگزاری کارگاه های آموزشی در سطوح مختلف جهت افزایش آگاهی کارکنان

در زمینه مراقبت بیماری ها این واحد با انجام مراقبت فعال و غیرفعال گزارشات مربوط به بیماری ها راجمع آوری و پس از تجزیه و تحلیل در خصوص آنها اقدام لازم بعمل می آورد.

بیماریهای مشمول گزارش شامل دو گروه بشـرح ذیل هستند:
بیماریهای مشمول گزارش فوری(تلفنی) : وبا، فلج شل حاد، سرخک، سندرم سرخچه مادرزادی، دیفتری، کزاز نوزادان (مواردمرگ،بستری دربیمارستان،آبسه،کلیه پیامدهای غیر معمول شدید یا خوشه ای بزرگ و هرگونه عارضه ای که باعث تشویش عمومی شود)،طاعون،تب زرد، مالاریا، سیاه زخم تنفسی، هرمورد حیوان گزیدگی وهرگونه افزایش ناگهانی موارد بیماریهای عفونی